在一片宁静而神秘的海边小村庄里，生活着一个充满好奇心的小男孩宗介。他是个热情开朗的孩子，总喜欢四处探险，寻找未知的冒险。有一天，他在海边发现了一只被困在玻璃瓶中的小金鱼。这只小金鱼不仅会说话，还自称是人类灵魂的守护者。
随着故事的发展，小金鱼其实是被邪恶力量诅咒的海神之女波妞。她渴望变成真正的人类，为了实现这个愿望，她必须得到宗介的帮助。两人之间的友谊迅速加深，宗介也决定帮助波妞摆脱困境。
然而，波妞的姐姐们并不希望她离开海洋世界，她们千方百计地想要将波妞带回海底。与此同时，一位邪恶的魔法师也在暗中策划着更大的阴谋，试图利用波妞的力量来统治整个海洋和陆地。
为了保护波妞，宗介和他的母亲理惠一起努力，不仅要对抗那些来自海洋的威胁，还要面对人类世界的种种挑战。在这一过程中，他们逐渐明白了勇气、责任以及爱的重要性。
最终，在宗介坚定的支持下，波妞成功地克服了所有的困难，实现了自己的梦想，同时也找到了属于自己的幸福归宿。这部电影以其独特的画风和感人的故事情节赢得了全球观众的喜爱，成为一部经典之作。
